近三十年來，隨著台灣宣布解嚴，許多在過去原本不受重視的議題，都跟隨這股民主自由浪潮興起的浪花接踵而至地被提出，其中環境教育也是如此，民國六十七年（1978年），淡水竹圍因為當時的省水利局研擬在竹圍開發為國宅用地
，生態保育學術界群起反對，為紅樹林請命。

　　民國六十九年（1980 年）3 月行政院決議紅樹林成長地區應予保護。六年後的民國七十五年（1986 年）6 月，行政院農業委員會依文化資產保存法公告設置「淡水河紅樹林自然保留區」，以確保水筆仔之永續生存。

　　位在台北捷運淡水信義線紅樹林站2號出口的「紅樹林生態教育館」，成立於民國八十六年（1997 年），緊鄰著淡水河紅樹林自然保留區。因為紅樹林植物與生態系十分可貴，設立教育館之目的，就是為了推廣保護紅樹林自然保留區的理念。室內現有的展示空間類型包括靜態展示空間與多媒體視聽空間，運用圖文、海報、與多媒體影音等方式，介紹紅樹林明星物種——水筆仔的生長過程，以及紅樹林中的招潮蟹、彈塗魚與水鳥等生態。

　　保留區另設有木棧道，可近距離觀察保留區
，也透過視野極佳的觀景窗，一覽壯觀秀麗的成片紅樹林景觀、淡水河的河口海景、觀音山的山色及壯闊鮮紅的關渡大橋。

　　2019年2月至今，林務局羅東林區管理處委託荒野保護協會經營管理，館內展示設施將陸續更新，撘配駐館人員環境解說導覽及國家森林志工於戶外紅樹林木棧道定點定時生態解說，提供一般民眾及各級學校做為紅樹林生態及生物的教學場所，欲前往淡水地區的遊客不妨安排半天欣賞紅樹林生態教育館在這守護了23年的自然保留區之美景，絕對讓您不虛此行。
　

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